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See detailA côté des produits de la prairie, quels aliments pour complémenter les rations des vaches laitières ?
Beckers, Yves ULg

Conference given outside the academic context (2014)

Detailed reference viewed: 40 (3 ULg)
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See detailInfluence du changement climatique sur l'accroissement du hêtre en Wallonie
Latte, Nicolas ULg; Claessens, Hugues ULg

Conference (2014, January 28)

Depuis quelques décennies, des signes d’affaiblissement de plus en plus marqués ont été observés sur le hêtre (Fagus sylvatica L.) un peu partout en Europe. L’inquiétude grandissante des gestionnaires ... [more ▼]

Depuis quelques décennies, des signes d’affaiblissement de plus en plus marqués ont été observés sur le hêtre (Fagus sylvatica L.) un peu partout en Europe. L’inquiétude grandissante des gestionnaires forestiers s’inscrit dans la problématique complexe du changement climatique. Une étude dendroécologique a donc été réalisée afin de mieux comprendre la relation entre l’accroissement du hêtre et son environnement. Des mesures de cernes ont été effectuées sur des échantillons de bois issus de 158 hêtres sélectionnés dans douze hêtraies (de 84 à 206 ans) situées le long du gradient climatique de Wallonie (de 67 à 590 m d’altitude). L’analyse de l’évolution temporelle de l’accroissement et de sa relation avec le climat a abouti à 3 résultats majeurs : (1) l’accroissement du hêtre a augmenté à partir des années 30 puis à diminuer de manière soutenue à partir des années 1980, (2) la sensibilité climatique des hêtraies a aussi fortement augmenté et cette augmentation est plus forte pour les peuplements de base altitude, et (3) les températures plus élevées en été et en début d’automne ont un impact négatif de plus en plus prononcé sur l’accroissement. Le réchauffement global rend les arbres de plus en plus dépendants de l’eau disponible (précipitation et sol). Les sécheresses et canicules plus fréquentes et intenses semblent progressivement affaiblir les arbres que puissent de plus en plus dans leur réserve. L’étude comprend une discussion complète intégrant l’interprétation écophysiologique des résultats mis en évidence. [less ▲]

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See detailEtude de la croissance et du niveau de production des peuplements résineux en Wallonie
Perin, Jérôme ULg

Conference given outside the academic context (2014)

Nos recherches visent à améliorer les connaissances de base en sylviculture et en écologie des essences résineuses dans l’optique d’une gestion forestière à vocation principale de production de bois de ... [more ▼]

Nos recherches visent à améliorer les connaissances de base en sylviculture et en écologie des essences résineuses dans l’optique d’une gestion forestière à vocation principale de production de bois de qualité. Nos études se focalisent principalement sur les futaies équiennes pures de douglas, d'épicéa et de mélèzes mais il est prévu de les étendre aux peuplements mélangés d'épicéa-douglas. D'un point de vue pratique, cette action de recherche vise, à terme, à proposer différents scénarios sylvicoles qui devraient fournir un panel de solutions techniques directement applicables sur le terrain, en fonction des essences elles-mêmes, des stations et des conditions locales particulières auxquelles les sylviculteurs sont confrontés. A cet effet, nous tentons de mieux comprendre les relations liant la croissance en hauteur et en grosseur des arbres avec les caractéristiques des peuplements comme la surface terrière, le volume ou le nombre de tiges. Dans un premier temps, de nouveaux modèles de productivité ont été élaborés pour l'épicéa, le douglas et les mélèzes. Ils permettent une estimation rapide et précise du potentiel de production d'un peuplement à partir de la connaissance de sa hauteur dominante et de son âge. Ces modèles ont été incorporés dans une application informatique simple d'utilisation mise à la disposition du public. Plus récemment, nous avons finalisé la mise au point de nouveaux modèles de croissance en grosseur et d'outils permettant de simuler les prélèvements et la mortalité naturelle. Tous ces modèles et ces outils ont été intégrés au sein d'un simulateur nommé "GYMNOS". Ce module informatique permet de simuler l'évolution des peuplements résineux de la plantation à la mise à blanc et de tester des scénarios sylvicoles. La vitesse de croissance, la rentabilité, la qualité du bois produit, la stabilité des peuplements,... sont actuellement évalués dans GYMNOS en fonction de divers paramètres tels que les densités de plantation, l'âge du peuplement lors de la première éclaircie, l'intensité et la fréquence des prélèvements, le terme d'exploitabilité,... L'analyse critique du résultat de tous ces tests mènera à définir les caractéristiques des nouveaux scénarios sylvicoles optimisés pour les pessières, les douglasaies et les mélézières. [less ▲]

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See detailLes dispositifs enclos-exclos : une solution pour évaluer l’équilibre forêt-grande faune
Lehaire, François ULg

Conference given outside the academic context (2014)

Au cours des dernières décennies, l’augmentation des populations des grands ongulés herbivores et leur influence sur la végétation forestière ont été clairement mises en évidence. Cette situation explique ... [more ▼]

Au cours des dernières décennies, l’augmentation des populations des grands ongulés herbivores et leur influence sur la végétation forestière ont été clairement mises en évidence. Cette situation explique que le contrôle et le suivi de la pression de la grande faune sur l’écosystème constitue une des préoccupations majeures des forestiers. Il convient de mettre en oeuvre une démarche objective et rigoureuse pour diagnostiquer l’état de l’équilibre sylvo-cynégétique. Dans ces conditions, le recours à des dispositifs de type enclos-exclos constitue une alternative intéressante dans la mesure où ils permettent de mettre en évidence des situations de déséquilibre ou de détecter de manière précoce toute dégradation d’une situation jugée initialement acceptable. En Wallonie, les dispositifs enclos-exclos utilisés reposent sur la comparaison, d’une part, du milieu réel (exclos) complètement accessible à la grande faune présente dans la zone d’étude et, d’autre part, d’un milieu dit de « contrôle » (enclos) inaccessible à toutes populations de grands ongulés (sanglier, cerf, chevreuil et mouflon). Les enclos-exclos jouent un rôle didactique indéniable en exposant côte à côte deux situations qui peuvent être très contrastées. Au-delà de cet aspect visuel, des données objectives peuvent être rapidement collectées pour réaliser sur une base statistique des analyses plus détaillées (relevé floristique, ainsi que hauteur, nombre de tiges et recouvrement de certaines strates de végétation). En 2006, plusieurs dispositifs pilotes (4 x 4 mètres) ont été installés dans des trouées forestières pour suivre la dynamique de la végétation basse (herbacée et ligneuse). Les observations ainsi récoltées jusque 2012 ont permis de calculer une série d’indicateurs susceptibles d’objectiver la pression subie par l’écosystème forestier sous l’action des grands herbivores. [less ▲]

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See detailQuantifier la ressource forestière grâce au LiDAR - Quelques applications concrètes
Bonnet, Stéphanie ULg; Dedry, Laurent ULg; Bauwens, Sébastien ULg et al

Conference given outside the academic context (2014)

Après l’avènement des Systèmes d’Information Géographique et l’utilisation de plus en plus répandue des images aériennes et satellitaires, le LiDAR constitue une nouvelle avancée dans la quantification et ... [more ▼]

Après l’avènement des Systèmes d’Information Géographique et l’utilisation de plus en plus répandue des images aériennes et satellitaires, le LiDAR constitue une nouvelle avancée dans la quantification et le monitoring des ressources naturelles en général et forestières en particulier. Le LiDAR est une technologie d’acquisition d’information en trois dimensions. Collectées le plus souvent à partir d’un avion, les données LiDAR prennent la forme de nuages de points plus ou moins denses qui décrivent finement les structures tridimensionnelle des zones observées et donc du couvert végétal dans le cas de zones forestières. Même si, à l'heure actuelle, l’acquisition des données reste encore relativement coûteuse et leur traitement apparemment complexe, les perspectives d’utilisation de ces données apparaissent très prometteuses au plan de la gestion forestière. [less ▲]

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See detailKisspeptin and neuronal nitric oxide signaling are important in female sexual behavior
Hellier, Vincent ULg; Bakker, Julie

Poster (2014, January 27)

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See detailExploration du récit de vie chez les adolescents: A la croisée du qualitatif et du quantitatif
Boulard, Aurore ULg

Scientific conference (2014, January 27)

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See detailThe small Heat Shock Proteins (HSPs) response following eccentric exercise
Hody, Stéphanie ULg; Simonet, Arnaud; Lacrosse, Zoé ULg et al

in Abstract Book GIGA Day 2014 (2014, January 27)

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See detailGIGA ANIMAL CARE : Mice & Zebrafish Animal Facility and Transgenesis
Remy, Benoît ULg; Ectors, Fabien ULg; Winandy, Marie ULg et al

Poster (2014, January 27)

In fundamental research, animal models allow to place molecular and cellular observations back into their physiological context. In applied research, these models still remain a mandatory step to evaluate ... [more ▼]

In fundamental research, animal models allow to place molecular and cellular observations back into their physiological context. In applied research, these models still remain a mandatory step to evaluate the efficiency and the toxicity of potential treatments, before going to clinical trials. Mouse and Zebrafish (Danio rerio) are two very interesting models because of a short live cycle and a high prolificacy. They require a limited space. Their genome is well known and shows a high homology with the human. Many tools are available to produce transgenic mice or zebrafishes. Many tests are validated using both these species. [less ▲]

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See detailCryopreservation of embryos : a way to reduce the number of housed animals and the genetic drift.
Remy, Benoît ULg; Ectors, Fabien ULg; Drion, Pierre ULg

Poster (2014, January 27)

The GIGA Mouse facility platform has recently improved its mouse line cryopreservation technique. The method of embryo cryopreservation by rapid cooling also called aseptic vitrification has been selected ... [more ▼]

The GIGA Mouse facility platform has recently improved its mouse line cryopreservation technique. The method of embryo cryopreservation by rapid cooling also called aseptic vitrification has been selected. Vitrification media, key steps and timing have been optimized and validated. After a first partial exposition of the embryos to cryoprotective solutions, they are immersed in a vitrifying mixture of penetrating and non-penetrating cryoprotectants for a short time. The straw containing the embryos is immediately sealed before to be plunged in LN2, resulting in a brutal solidification in which crystallization does not have time to occur. [less ▲]

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See detailProtein Structural Annotation: Multi-Task Learning and Feature Selection
Becker, Julien ULg

Doctoral thesis (2014)

Experimentally determining the three-dimensional structure of a protein is a slow and expensive process. Nowadays, supervised machine learning techniques are widely used to predict protein structures, and ... [more ▼]

Experimentally determining the three-dimensional structure of a protein is a slow and expensive process. Nowadays, supervised machine learning techniques are widely used to predict protein structures, and in particular to predict surrogate annotations, which are much less complex than 3D structures. This dissertation presents, on the one hand, methodological contributions for learning multiple tasks simultaneously and for selecting relevant feature representations, and on the other hand, biological contributions issued from the application of these techniques on several protein annotation problems. Our first methodological contribution introduces a multi-task formulation for learning various protein structural annotation tasks. Unlike the traditional methods proposed in the bioinformatics literature, which mostly treated these tasks independently, our framework exploits the natural idea that multiple related prediction tasks should be designed simultaneously. Our empirical experiments on a set of five sequence labeling tasks clearly highlight the benefit of our multi-task approach against single-task approaches in terms of correctly predicted labels. Our second methodological contribution focuses on the best way to identify a minimal subset of feature functions, {\em i.e.}, functions that encode properties of complex objects, such as sequences or graphs, into appropriate forms (typically, vectors of features) for learning algorithms. Our empirical experiments on disulfide connectivity pattern prediction and disordered regions prediction show that using carefully selected feature functions combined with ensembles of extremely randomized trees lead to very accurate models. Our biological contributions are mainly issued from the results obtained by the application of our feature function selection algorithm on the problems of predicting disulfide connectivity patterns and of predicting disordered regions. In both cases, our approach identified a relevant representation of the data that should play a role in the prediction of disulfide bonds (respectively, disordered regions) and, consequently, in protein structure-function relationships. For example, the major biological contribution made by our method is the discovery of a novel feature function, which has - to our best knowledge - never been highlighted in the context of predicting disordered regions. These representations were carefully assessed against several baselines such as the 10th Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) competition. [less ▲]

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See detailScikit-Learn: Machine Learning in the Python ecosystem
Joly, Arnaud ULg; Louppe, Gilles ULg

Poster (2014, January 27)

The scikit-learn project is an increasingly popular machine learning library written in Python. It is designed to be simple and efficient, useful to both experts and non-experts, and reusable in a variety ... [more ▼]

The scikit-learn project is an increasingly popular machine learning library written in Python. It is designed to be simple and efficient, useful to both experts and non-experts, and reusable in a variety of contexts. The primary aim of the project is to provide a compendium of efficient implementations of classic, well-established machine learning algorithms. Among other things, it includes classical supervised and unsupervised learning algorithms, tools for model evaluation and selection, as well as tools for data preprocessing and feature engineering. This presentation will illustrate the use of scikit-learn as a component of the larger scientific Python environment to solve complex data analysis tasks. Examples will include end-to-end workflows based on powerful and popular algorithms in the library. Among others, we will show how to use out-of-core learning with on-the-fly feature extraction to tackle very large natural language processing tasks, how to exploit an IPython cluster for distributed cross-validation, or how to build and use random forests to explore biological data. [less ▲]

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See detailChangement, disparition ou éternel retour ?
Gauthier, Jean-Marie ULg; Englebert, Jérôme ULg

Scientific conference (2014, January 27)

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Peer Reviewed
See detailUntangling spatial and temporal trends in the variability of the Black Sea Cold Intermediate Layer and mixed Layer Depth using the DIVA detrending procedure
Capet, Arthur ULg; Troupin, Charles ULg; Cartensen, Jacob et al

in Ocean Dynamics (2014), 64(3), 315-324

Current spatial interpolation products may be biased by uneven distribution of measurements in time. This manuscript presents a detrending method that recognizes and eliminates this bias. The method ... [more ▼]

Current spatial interpolation products may be biased by uneven distribution of measurements in time. This manuscript presents a detrending method that recognizes and eliminates this bias. The method estimates temporal trend components in addition to the spatial structure and has been implemented within the Data Interpolating Variational Analysis (DIVA) analysis tool. The assets of this new detrending method are illustrated by producing monthly and annual climatologies of two vertical properties of the Black Sea while recognizing their seasonal and interannual variabilities : the mixed layer depth, and the cold content of its Cold Intermediate Layer (CIL). The temporal trends, given as by-products of the method, are used to analyze the seasonal and interannual variability of these variables over the past decades (1955-2011). In particular, the CIL interannual variability is related to the cumulated winter air temperature anomalies, explaining 88\% of its variation. [less ▲]

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See detailL’apport des cultes royaux hellénistiques au débat sur la polis religion dans le monde hellénistique
Caneva, Stefano ULg

Conference (2014, January 25)

La contribution suivante attire l’attention sur quelques enjeux du projet de recherche mené par l’Auteur, intitulé « Ritual Practicalities of Hellenistic Ruler Cults: A ‘Practice-Turn’ in the religious ... [more ▼]

La contribution suivante attire l’attention sur quelques enjeux du projet de recherche mené par l’Auteur, intitulé « Ritual Practicalities of Hellenistic Ruler Cults: A ‘Practice-Turn’ in the religious and social history of the Hellenistic period ». Le but de ce projet est de combler une lacune dans la recherche sur les cultes royaux hellénistiques en déplaçant l’attention de leurs justifications idéologiques, qui a occupé jusqu’ici une position prioritaire dans les études, à la pratique religieuse et à ses fondements sociaux. L’attention se concentrera donc sur les actes cultuels, en se posant la question de savoir comment, par qui et dans quels contextes les rituels pour les souverains furent intégrés dans la vie religieuse des communautés hellénistiques. Il s’agira de combiner l’histoire religieuse (usage, adaptation et innovation des traditions religieuses antérieures et d’éléments particuliers du culte en relation avec les cultes royaux) et l’histoire sociale et politique (les cultes royaux dans les dynamiques locales et globales ; développements diachroniques). L’aspect sur lequel se concentre la communication présente concerne la place méthodologique de l’étude des cultes royaux dans le débat sur la « polis religion » et l’ « individualisation du religieux » dans le monde gréco-romain. [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailImprovement of a stability-indicating method by Quality-by-Design versus Quality-by-Testing: A case of a learning process
Hubert, Cédric ULg; Lebrun, Pierre ULg; Houari, Sabah ULg et al

in Journal of Pharmaceutical & Biomedical Analysis (2014), 88

The understanding of the method is a major concern when developing a stability-indicating method and even more so when dealing with impurity assays from complex matrices. In the presented case study, a ... [more ▼]

The understanding of the method is a major concern when developing a stability-indicating method and even more so when dealing with impurity assays from complex matrices. In the presented case study, a Quality-by-Design approach was applied in order to optimize a routinely used method. An analytical issue occurring at the last stage of a long-term stability study involving unexpected impurities perturbing the monitoring of characterized impurities needed to be resolved. A compliant Quality-by-Design (QbD) methodology based on a Design of Experiments (DoE) approach was evaluated within the framework of a Liquid Chromatography (LC) method. This approach allows the investigation of Critical Process Parameters (CPPs), which have an impact on Critical Quality Attributes (CQAs) and, consequently, on LC selectivity. Using polynomial regression response modeling as well as Monte Carlo simulations for error propagation, Design Space (DS) was computed in order to determine robust working conditions for the developed stability-indicating method. This QbD compliant development was conducted in two phases allowing the use of the Design Space knowledge acquired during the first phase to define the experimental domain of the second phase, which constitutes a learning process. The selected working condition was then fully validated using accuracy profiles based on statistical tolerance intervals in order to evaluate the reliability of the results generated by this LC/ESI-MS stability-indicating method. A comparison was made between the traditional Quality-by-Testing (QbT) approach and the QbD strategy, highlighting the benefit of this QbD strategy in the case of an unexpected impurities issue. On this basis, the advantages of a systematic use of the QbD methodology were discussed. [less ▲]

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