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See detailGénération d’une librairie de mutants de Bacillus licheniformis 749/I par l’insertion aléatoire d’un transposon pour identifier les gènes impliqués dans l’induction de la β-lactamase BlaP
Lebrun, Sarah ULg

Doctoral thesis (2017)

La production de la b-lactamase BlaP chez Bacillus licheniformis 749/I est induite par la présence d’un antibiotique à noyau b-lactame (b-lactamine) dans le milieu extérieur. Le récepteur membranaire ... [more ▼]

La production de la b-lactamase BlaP chez Bacillus licheniformis 749/I est induite par la présence d’un antibiotique à noyau b-lactame (b-lactamine) dans le milieu extérieur. Le récepteur membranaire BlaR1 détecte la présence de la b-lactamine et transmet un signal vers le cytoplasme. La protéine BlaR1 est composée de deux domaines : le domaine C-terminal (BlaR-CTD) exposé à l’extérieur de la cellule qui détecte la présence de l’antibiotique et le domaine N-terminal membranaire (BlaR-NTD) agissant comme un transducteur et un amplificateur du signal perçu par le domaine senseur. En présence de b-lactamine, l’acylation de BlaR-CTD par l’antibiotique entraîne un changement conformationnel des segments transmembranaires menant à l’activation de la boucle L3 de BlaR-NTD. Le répresseur BlaI, qui réprime la transcription du gène blaP, est inactivé par liaison d’un coactivateur, le dipeptide D-Glu--mA2pm issu de la dégradation du peptidoglycane à l’extérieur de la cellule. La voie d’entrée de ce dipeptide n’est pas connue ainsi que le locus blaR2 impliqué dans l’induction de la b-lactamase. L’objectif principal de ce travail est l’identification du locus blaR2 par la construction d’une banque aléatoire de mutants par transposition. La première étape du travail était la mise au point de la transformation de Bacillus licheniformis 749/I par un plasmide possédant une origine thermosensible et porteur d’un transposon modifié. Un clone recombinant a été obtenu par la méthode de transformation de protoplastes avec de l’ADN sous forme concatémère. Une banque d’environ 11.300 clones a été générée et validée. Une méthode de criblage sur boite via un test iodométrique a mis en évidence cinq mutants sur l’entièreté de la banque présentant une différence d’induction par rapport à la souche sauvage. L’identification des insertions chromosomique du transposon a été réalisée par PCR inverse et par AP-PCR et a permis d’identifier trois clones insérés dans le gène blaR1 et deux dans le gène blaP. Ces mutants sont tous différents entre eux. Une seconde stratégie a été envisagée en vue d’identifier le locus blaR2 par complémentation du mutant chimique blaR2- par l’ADN génomique isssus des mutants de la souche sauvage générés à partir du transposon. La souche blaR2- a été transformée cependant, aucun événement de recombinaison n’a pu être observé. Sur base de ces expériences, la question de l’identification du locus blaR2 reste en suspens. Néanmoins, au cours de l’isolement des clones contenant le transposon, nous avons mis en évidence des clones présentant des colonies possédant un phénotype « luisant » par rapport à l’aspect mat de la souche sauvage. Un gène codant pour une estérase (Bl-EstA) a été ainsi identifié et le produit du gène étudié. Bl-EstA appartient à la famille des lipases « hormone-sensitive lipase like_1 » (Famille IV de la classification d’Arpigny et Jaeger (1999)) et possède toutes les caractéristiques des a/b hydrolases. Bl-EstA est sous la forme dimérique en solution et peut adopter différents comportements cinétiques en fonction des substrats qu’elle hydrolyse : une cinétique Michaélienne classique, allostérique ainsi qu’une inhibition par le substrat. Ces comportements impliquent, au moins, la présence d’un site régulateur. Enfin, l’inactivation de Bl-EstA par les alcools n’est pas favorable à son utilisation pour des réactions de transestérifications et dès lors pour des applications industrielles. [less ▲]

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See detailLe fléau des faux médicaments
Marini Djang'Eing'A, Roland ULg; Ziemons, Eric ULg; Sacre, Pierre-Yves ULg et al

Conference given outside the academic context (2017)

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See detailActivités et production de méthane des bovins au pâturage
Blaise, Yannick ULg; Andriamandroso, Andriamasinoro ULg; Castro Muñoz, Eloy ULg et al

Conference given outside the academic context (2017)

Quels sont les liens entre les comportements des bovins et les caractéristiques de la prairie sur la dynamique de production de méthane (CH4)?

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See detailLa musica di fra Giovanni da Verona - presentazione monografia Classiques Garnier
Bugini, Mariaelena ULg

Scientific conference (2017, March 30)

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See detailModélisation spatiale de la production fourragère en zone pastorale nigérienne
Garba, Issa ULg

Doctoral thesis (2017)

This work was carried out on the pastoral zone of Niger, the main objective was to contribute to the improvement of the methods of forage yields predicting mainly in the Sahel and especially in Niger ... [more ▼]

This work was carried out on the pastoral zone of Niger, the main objective was to contribute to the improvement of the methods of forage yields predicting mainly in the Sahel and especially in Niger. This is specifically to validate the model BIOMASAH of ARC; test the MEIA model; to establish a reference model by multiple linear regression; test the similarity method and finally compare the methods. The work was carried out on the one hand with the data measured on the ground by the MEIA from 2001 to 2012, reel rainfall of Niger observations network, meteorological parameters from ECMWF and also with satellite images as SPOT NDVI VEGETATION and MODIS, RFE2 of FEWS NET. Validation of BIOMASAH model was made by t and Wilcoxon tests to compare reel biomass and outputs of the model. Pearson, Kendall and Spearman correlation testing was also made. The MEIA model performance was tested by confronting the results between and within SPOT VEGETATION and MODIS sensors, by comparing R² and RMSE from the integral and maximum NDVI as a predictor of forage yield. Average comparisons by parametric and nonparametric tests were also made to compare the results. The reference model (RM) was produced by multiple linear regression with stepwise method. The selection of variables was based on adjusted R² and RMSE and the LOOCV leave one out cross validation to calculate R² for validation, we made also systematic diagnosis of residues for better characterization of the model. The similarity method was performed using the R², MAD and RMSE as a criterion, the profile of the vegetation growth period of each pixel was plotted for all years. Then we compare the profile of the target year with those of other years to identify the similar year. One hand the results of similarity were compared with actual data with the Pearson correlation test, Spearman and Kendall and secondly using t and Wilcoxon tests to compare means. Comparison of models was made on the basis of R², Adjusted R² and RMSE. Model BIOMASAH result on significant difference between average (p <0.001). Pearson correlations, Kendall and Spearman are low. Regarding the MEIA model, globally R² (0.56) is best, there’s no difference to use MODIS NDVI or SPOT vegetation, the RMSE is 367 kg.ha-1. R² and RMSE vary greatly from one year to another. On a global scale the multiple linear model gave a good R² adjusted (0.69) and RMSE (282 kg / ha) the difference between the calculated and the RMSE of validation is 2.72 kg. Comparing averages of the similarity to the real ones showed that there are no significant differences (p <0.001) for R² with the differences are significant against the same threshold for the MAD and RMSE. The Comparison of the models shows that the multiple linear regression one (reference model) is the best. Research should continue with index like LAI, FARAR and EVI. [less ▲]

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See detailPrecision design of novel bio-based and ethylene-based copolymers: application to advanced nanocomposites
Scholten, Philip ULg; Detrembleur, Christophe ULg; Demarteau, Jérémy ULg et al

Conference (2017, March 30)

Polyolefins are an inexpensive class of compounds that can be used to prepare a plethora of different materials. Poly(ethylene) is the worldwide most produced polymer and is mostly synthesised by free ... [more ▼]

Polyolefins are an inexpensive class of compounds that can be used to prepare a plethora of different materials. Poly(ethylene) is the worldwide most produced polymer and is mostly synthesised by free radical polymerisation or catalytic coordination insertion using high temperature and pressure. The controlled radical polymerisation of ethylene is very difficult to achieve because of secondary reactions of this unconjugated monomer, e.g. chain transfer and termination reactions. Cobalt-mediated radical polymerisation (CMRP) represents a solution to control its polymerisation in mild conditions: in a reversible deactivation mechanism, a cobalt complex reversibly traps the active growing chains and converts them into dormant species, avoiding side reactions and allowing for a controlled polymerisation. Using CMRP, statistical copolymers of ethylene and vinyl acetate (VAc) have been synthesised, as well as block-like and block copolymers. Furthermore, functionalisation of the α- and ω-chain ends are now possible. Polymerising a vinyl bio-based monomer using CMRP has also been investigated, with the goal of forming ethylene copolymers. The copolymerisation behaviour of this novel monomer was investigated using vinyl acetate as a model and the structure and thermal properties were analysed. The monomer is very promising and copolymerisations with ethylene are undergoing. It is expected, that these completely new and highly interesting materials may act as compatibilisers for the dispersion of natural polymers, such as cellulose, into various polymer matrices. [less ▲]

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See detailQuand la transition fait son cinéma (et pas l'inverse). Approche critique du documentaire "Demain".
Hamers, Jérémy ULg

Conference given outside the academic context (2017)

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See detailThe ballistic performance of prehistoric weapons: first results of a comparative study
Coppe, Justin ULg; Clarenne, Valérian; Pirlot, Marc et al

Conference (2017, March 30)

Projectile points have recently taken a prominent position in debates on the complexity of Paleolithic human behavior. While the appearance of hunting weapons in the archaeological record was a central ... [more ▼]

Projectile points have recently taken a prominent position in debates on the complexity of Paleolithic human behavior. While the appearance of hunting weapons in the archaeological record was a central element in early discussions, the debate has shifted towards the appearance of specific projecting modes. Given that the organic propulsion tools (bow, spear-thrower) are only rarely preserved, energy has been invested in experiments to explore how the projecting mode can be identified based on the analysis of stone points. These experiments usually attempt to control selected parameters in projectile use (e.g., speed, target, angle of impact), but the ballistic parameters that are used are generally based on heterogeneous and not commonly reported studies. Little research has focused on the measurement of the complete ballistic performance of prehistoric weapons. We present the first results of a systematic ballistic study that quantifies and compares different modes of propulsion. [less ▲]

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See detailOpen Science in Doctoral Education: Practical insights from the University of Liège
Halleux, Isabelle ULg; Stirbu, Simona ULg

Scientific conference (2017, March 29)

The practices of the University of Liège in terms of commitment to the "Open" movement have been presented, specifically at doctoral level.

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See detailLes mathématiques: une science comme les autres ?
Bair, Jacques ULg

E-print/Working paper (2017)

Les mathématiques sont-elles une science et, dans l'affirmative, sont-elles comparables aux autres disciplines scientifiques comme la physique, la biologie, ... ? Nous apportons des éléments de réponse à ... [more ▼]

Les mathématiques sont-elles une science et, dans l'affirmative, sont-elles comparables aux autres disciplines scientifiques comme la physique, la biologie, ... ? Nous apportons des éléments de réponse à de telles questions en basant principalement nos arguments sur la distinction, due au mathématicien-épistémologue G. Polya, entre les raisonnements plausibles ou démonstratifs. [less ▲]

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See detailDevelopment of Mass Spectrometry based Analytical Tools for Animal Venoms Characterization
Echterbille, Julien ULg

Doctoral thesis (2017)

Animal venoms and toxins are now recognized as major sources of bioactive molecules that may be tomorrow’s new drug leads. Their complexity and their potential as drug sources have been demonstrated by ... [more ▼]

Animal venoms and toxins are now recognized as major sources of bioactive molecules that may be tomorrow’s new drug leads. Their complexity and their potential as drug sources have been demonstrated by application of modern analytical technologies, which have revealed venoms to be vast peptide combinatorial libraries. Structural as well as pharmacological diversity is immense, and mass spectrometry is now one of the major investigative tools for the structural investigation of venom components. The present work is dedicated to the development of new mass spectrometry-based methodologies for the study of animal venoms. The first methodology depicts an original approach to sequence snake toxins in a higher throughput way after an orthogonal separation of the crude venom. The second analytical development is devoted to decipher disulfide connectivity in cone snails’ toxins through a combination of partial reduction/oxidation followed by ion mobility separation of the semi-reduced/oxidized species and CID fragmentation. The last part of this work is focused on the capture of ligands of nAChRs in complex mixtures of peptides, especially in cone snail venoms. A new ligand has been discovered and fully characterized. [less ▲]

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See detailSurvivre au maître. La vie artistique à Rome au lendemain de la mort de Raphaël
Trizzullo, Eva ULg

Conference (2017, March 29)

La mort de Raphaël Sanzio survenue à Rome le 6 avril 1520 provoqua un électrochoc au sein du milieu culturel romain. Célébré de son vivant, cet artiste incontournable le fut tout autant dans la mort. En ... [more ▼]

La mort de Raphaël Sanzio survenue à Rome le 6 avril 1520 provoqua un électrochoc au sein du milieu culturel romain. Célébré de son vivant, cet artiste incontournable le fut tout autant dans la mort. En attestent particulièrement les témoignages de contemporains, qu’ils soient hommes de lettres ou ambassadeurs. Cette communication sera à la fois l’occasion de se pencher sur ces précieux témoignages mais également d’appréhender comment cette disparition brutale fut perçue à travers l’historiographie ancienne et moderne. Ensuite, on analysera les conséquences de cet événement sur les développements artistiques de la première moitié du XVIe siècle. En effet, durant le printemps 1520, Raphaël était sollicité de toute part. Mais l’artiste n’était pas seul, et était secondé par une myriade de collaborateurs. Une fois le maître mort, qu’advint-il des commandes en cours ? Et surtout, quel tournant prit alors la carrière de ses élèves ? Grâce à l’analyse croisée des objets artistiques et textuels, je m’interrogerai sur l’impact qu’a pu avoir la disparition d’un artiste du calibre de Raphaël dans une Rome en pleine effervescence artistique. [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailModélisation de la qualité des eaux de surface à l’échelle d’un bassin versant agricole tunisien dans un contexte de changement climatique
Boukari, Amira; Everbecq, Etienne ULg; MAGERMANS, POL ULg et al

Conference (2017, March 29)

La dégradation considérable de la qualité de l’eau et les utilisations concurentielles de cette ressource par tous les secteurs s’accèlèrent, notamment en région méditerranéenne. Certains pays souffrant ... [more ▼]

La dégradation considérable de la qualité de l’eau et les utilisations concurentielles de cette ressource par tous les secteurs s’accèlèrent, notamment en région méditerranéenne. Certains pays souffrant déjà de la rareté de leurs ressources en eau seront de plus en plus menacés dans un futur proche. Cette situation de pénurie serait aggravée par les dérèglements climatiques qui menacent les ressources en eau par l’augmentation de l’évaporation des reservoirs et des plans d’eau et par la fréquence des inondatons et des sécheresses. La Tunisie fait partie des pays les plus vulnérables de la région méditerranéenne. Le pays est classé selon l’indice de Falkenmark parmi les pays en pénurie d’eau, ce qui rend la disponibilité naturelle de cette ressource insuffisante pour satisfaire une demande en hausse. En effet, selon l’organisation des nations unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO, 2014), les disponibilités en eau douce de la Tunisie baisseraient à 450 m3/habitant/an en 2030 et à 427 m3/habitant/an en 2050. En 2015, les apports cumulés aux barrages ont enregistré une baisse de 66% par rapport à la moyenne. Cette baisse a le plus affecté la région du Nord, forte contributrice au stockage d’eau de surface (plus de 80% des ressources en eau de surface). Le barrage Joumine était parmi les barrages les plus affectés par cette baisse enregistrant une perte de stockage de 37 Mm3 en une année, soit 30% de sa capacité utile actuelle. A cette baisse de la ressource s’associe la vulnérabilité à la pollution diffuse. En effet, le bassin versant de l’oued Joumine est un bassin versant agricole dominé par les cultures céréalières très exigeantes en intrants (192 milles tonnes d’Ammonitrate, 25,9 milles tonnes de superphosphate 45 et 82 milles tonnes de DAP pour le total des surfaces céréalières emblavées du pays) (DGPA, 2016). Dans ce travail, on estime ces apports issus des terres agricoles et évalue sa réponse face aux nombreuses pressions dans un contexte de changement climatique. La méthodologie adoptée implique, en plus des observations et prospection terrain, la représentation mathématique de la relation « pression – impact », modélisée par le logiciel PEGOPERA, outil de simulation numérique de l’écosystème rivière développé par l’Unité R&D de l’Aquapôle de l’Université de Liège. Le but étant de fournir une image de la qualité de l’eau de l’oued Joumine dans des conditions hydrologiques particulières, à un pas de temps journalier et en tout point du réseau en assurant des simulations physiquement basées avec un outil dédié au calcul déterministe des écosystèmes rivières à partir des données des débits mesurés, la température de l’eau, les insolations solaires et les rejets (Deliège et al., 2009; Deliege et al 2014 ; Grard et al 2014). La mise en place du modèle a nécessité la construction d’une base de données géographique à partir des informations relatives à l’occupation des terres et le relief, le tracé digitalisé des rivières et le découpage administratif par délégation. Des algorithmes de pré-processing PEGASE ont été appliqués pour la construction et la vérification de la topologie du réseau hydrographique, la génération des profils altimétriques des rivières et de la connectivité. Une méthode d’interfaçage a été par ailleurs définie avec le modèle agro-hydrologique SWAT en vue du calcul déterministe et explicite des apports diffus des sols tout en s’assurant de la cohérence des échelles temporelle et spatiale entre les deux modèles et des processus modélisés. Le modéle a été paramétré pour simuler l’état du systéme depuis l’année hydrologique 2015/2016 et des scénarios prospectifs sont en cours d’étude pour simuler la réponse du système dans des situations particulières, notamment les projections climatiques futures. [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailThe dual SSTR2/5 specific somatostatin analog, AP102, does not affect glucose metabolism in diabetic ZDF rats: a comparative 14-day infusion study versus pasireotide
Daly, Adrian ULg; Sumeray, Mark

in Abstract Book of the 15th International Pituitary Congress (2017, March 29)

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Peer Reviewed
See detailFORMATİON DU MONDE ENTREPRENEURİAL ET ASSOCİATİF À LA CULTURE DE SPİRULİNE EN HAÏTİ
MAGERMANS, POL ULg; DENGIS, Chantal; DETIENNE, Xavier et al

Conference (2017, March 29)

One of the solutions to malnutrition in developing countries is nutritional supplements. These, generally issued from food or pharmaceutical industry are too often expensive. A natural solution exists ... [more ▼]

One of the solutions to malnutrition in developing countries is nutritional supplements. These, generally issued from food or pharmaceutical industry are too often expensive. A natural solution exists: Spirulina. A farm school project with the Faculty of Agronomy and Veterinary Medicine (FAMV) of the State University of Haiti (UEH), financed by WBI between 2010 and 2013, has already made it possible to construct a series of basins and to familiarize a university team of this faculty with the culture of Spirulina. The current project (2015-2018) aims to disseminate knowledge of Spirulina culture techniques in the Haitian entrepreneurial and associative world, hoping to see more artisanal farms in the country. [less ▲]

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