[en] Structural analogy between D-alanyl-D-alanine terminated peptides (and analogues) of varying substrate activity toward D-alanyl-D-alanine-cleaving peptidases, and bicyclic fused ring azetidinone structures of varying inactivating potency toward the same enzymes has been exa-mihed by comparing the relative spatial disposition of the carboxylate function at the C-terminal position and the amide function at the N-terminal position with respect to the scissile amide bond at the central position. The observed variations in the geometric parameters and the molecular electrostatic potential maps generated by these functional groups suggest multiple modes of binding. In the monobactam sulfazecin, the relative disposition of at least the scissile amide bond and the terminal sulphamate group is comparable to that of the corresponding functions in the bicyclic β-lactams. [fr] Le degré d'analogie structurale entre, d'une part, peptides se terminant par la séquence D-alanyl-D-alanine (et analogues) et doués d'activité de substrat variable vis-à-vis des DD-peptidases et, d'autre part, β-lactamines bicycliques douées de pouvoir inactivateur variable vis-à-vis de ces mêmes enzymes a été examiné en comparant la disposition spatiale relative des fonctions carboxylate et amide qui se situent, respectivement, en position C-terminale et en position N-terminale par rapport à la liaison peptidique (amidique) sensible. Les paramètres géométriques et les cartes de potentiel électrostatique générées par ces trois fonctions suggèrent des modes multiples de fixation aux centres actifs de ces enzymes. La disposition relative du groupement sulfamate terminal et de la liaison amidique sensible dans la β-lactamine monocyclique, sulfazecine, est comparable à celle des fonctions correspondantes dans les β-lactamines bicycliques.
Lamotte-Brasseur, Josette ; Université de Liège - ULiège > Institut de Physique > Unité de cristallographie
Dive, Georges ; Université de Liège - ULiège > Institut de Pharmacie > Laboratoire de Chimie pharmaceutique
Ghuysen, Jean-Marie ; Université de Liège - ULiège > Institut de Chimie > Service de Microbiologie
Language :
English
Title :
On the structural analogy between D-alanyl-D-alanine terminated peptides and β-lactam antibiotics
Publication date :
1984
Journal title :
European Journal of Medicinal Chemistry
ISSN :
0223-5234
eISSN :
1768-3254
Publisher :
Elsevier, Paris, France
Volume :
4
Pages :
319-330
Peer reviewed :
Peer Reviewed verified by ORBi
Funders :
FRSM - Fonds de la Recherche Scientifique Médicale [BE]
Commentary :
Die strukturelle Analogie zwischen D-Alanyl-D-alanin-terminalen Peptiden (und Analoga) mit verschiedener Substrataktivi-tät gegenüber D-Alanyl-D-analin-spaltenden Peptidasen und bicycschen kondensierten Azetidinonen mit unterschiedlicher Hemmwirkung auf die gleichen Enzyme wurde untersucht. Dazu wurden die relative räumliche Anordnung der C-terminalen Carboxyl-Gruppe und der N-terminalen Amid-Gruppe in Hinblick auf die zu spaltende Amid-Bindung verglichen. Die beobachteten Variationen der geometrischen Parameter und die Verteilung der molekularen elektrostatischen Potentiale, die durch diese funktionellen Gruppen erzeugt werden, lassen auf verschiedene Bindungs-partner schlieβen. In dem Monolactam Sulfazecin ist zumindest die relative Anordnung der zu spaltenden Amid-Bindung und der terminalen Sulfamat-Gruppe vergleichbar jener der entsprechenden Funktionen in den bicyclischen β-Lactamen.
