Reference : Polymorphic miRNA-target interactions : A Novel Source of Phenotypic Variation
Scientific congresses and symposiums : Paper published in a journal
Life sciences : Genetics & genetic processes
Engineering, computing & technology : Computer science
http://hdl.handle.net/2268/90681
Polymorphic miRNA-target interactions : A Novel Source of Phenotypic Variation
English
Georges, Michel mailto [Université de Liège - ULg > Département de productions animales > GIGA-R : Génomique animale >]
Clop, Alex [Université de Liège - ULG > Département de productions animales > GIGA-R : Génomique animale > >]
Marcq, Fabienne mailto [Université de Liège - ULg > Département clinique des animaux de compagnie et des équidés > Département clinique des animaux de compagnie et des équidés >]
Takeda, Haruko mailto [Université de Liège - ULg > Département de productions animales > GIGA-R : Génomique animale >]
Pirottin, Dimitri mailto [Université de Liège - ULg > Département de sciences fonctionnelles > Département de sciences fonctionnelles >]
Tordoir, Xavier mailto [Université de Liège - ULg > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation >]
Hiard, Samuel mailto [Université de Liège - ULg > Dép. d'électric., électron. et informat. (Inst.Montefiore) > Systèmes et modélisation > > >]
Bibé, B. [Institut National de la Recherche Agronomique > Station d'Amélioration Génétique des Animaux > > >]
Bouix, J. [Institut National de la Recherche Agronomique > Station d'Amélioration Génétique des Animaux > > > >]
Caiment, Florian [Université de Liège - ULg > Département de productions animales > GIGA-R : Génomique animale >]
Eychenne, F. [Institut National de la Recherche Agronomique > Station d'Amélioration Génétique des Animaux > > > >]
Larzul, C. [Institut National de la Recherche Agronomique > Station d'Amélioration Génétique des Animaux > > > >]
Laville, E. [Institut National de la Recherche Agronomique > Station d'Amélioration Génétique des Animaux > > > >]
Meish, F. [Université de Liège - ULG > Département de productions animales > GIGA-R : Génomique animale > >]
Milenkovic, D. [Institut Scientifique de Recherche Agronomique - INRA > Faculté des sciences > > >]
Tobin, J. [University of Cambridge > Wyeth Research > Cardiovascular and Metabolic Diseases > >]
Charlier, Carole mailto [Université de Liège - ULg > Département de productions animales > GIGA-R : Génomique animale >]
Jun-2006
Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology
Cold Spring Harbor Laboratory Press
71
343-350
Yes (verified by ORBi)
No
International
0091-7451
Woodbury
NY
Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 2006
2006
Bruce Stillman and David Stewart
New York
USA
[en] bioinformatics ; Polymorphic ; miRNA ; target ; interaction ; phenotypic
[en] Studying the muscular hypertrophy of Texel sheep by forward genetics, we have identified an A-to-G transition in the 3'UTRof the GDF8 gene that reveals an illegitimate target site for microRNAs miR-1 and miR-206 that are highly expressed in skeletal muscle. This causes the down-regulation of this muscle-specific chalone and hence contributes to the muscular hypertrophyof Texel sheep. We demonstrate that polymorphisms which alter the content of putative miRNA target sites are commonin human and mice, and provide evidence that both conserved and nonconserved target sites are selectively constrained. Wespeculate that these polymorphisms might be important mediators of phenotypic variation including disease. To facilitatestudies along those lines, we have constructed a database (www.patrocles.org) listing putative polymorphic microRNA–targetinteractions.
Systmod
Professionals
http://hdl.handle.net/2268/90681
10.1101/sqb.2006.71.056
http://www.montefiore.ulg.ac.be/services/stochastic/pubs/2006/GCMTPTHBBCELLMMTC06
Regulatory RNAs - Cold Spring Harbor Symposium on Quantitative Biology

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