References of "Blibek, Karim"
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Peer Reviewed
See detailThe human PDZome: a gateway to PDZ mediated functions.
Belotti, Edwige; Polanowska, Jolanta; Daulat, Avais M. et al

in Molecular & Cellular Proteomics (2013), 12(9), 25872603

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Peer Reviewed
See detailAn interaction map for HTLV-1 Tax and PDZ-containing proteins.
Blibek, Karim ULg; Rambout, Xavier ULg; beaufays, Jérôme et al

Poster (2013, June 29)

Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) retrovirus encodes for the Tax protein, which has a transforming capacity in vitro. Tax contains at its C-terminus a binding motif for PDZ domain-containing ... [more ▼]

Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) retrovirus encodes for the Tax protein, which has a transforming capacity in vitro. Tax contains at its C-terminus a binding motif for PDZ domain-containing proteins (PSD95-DLG1-ZO1). It has been shown that the C-terminal motif of Tax is involved in Tax oncogenic capacity. Ten different PDZ domain-containing proteins have been reported to interact with Tax, but the specificity of Tax-human PDZome interactions has not been investigated. The objective of this study is to obtain a comprehensive interactome map for Tax and the human PDZome and to determine a global role of Tax-PDZ interactions in HTLV-1 biology. [less ▲]

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See detailInhibition of Tax transformation activity using a small molecule targetting Tax/PDZ domain interactions.
Blibek, Karim ULg; Fujii, Naoaki; Legros, Sebastien et al

Poster (2013, June 29)

Primate T-lymphotropic virus species comprise four members (HTLV-1 to -4) that have been discovered in human. Only the HTLV-1 infection leads to adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) and tropical spastic ... [more ▼]

Primate T-lymphotropic virus species comprise four members (HTLV-1 to -4) that have been discovered in human. Only the HTLV-1 infection leads to adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) and tropical spastic paraparesis (TSP), an immune degenerative neurologic syndrome. All the four viruses share a similar genomic organization and encode transforming Tax oncoproteins. In contrast to HTLV-2 and 4, HTLV-1 and 3 Tax proteins contain a PSD-95/Drosophila Discs Large/Zona Occludens-I (PDZ) binding motif at their C-terminal that has been shown to play crucial roles in the distinct transforming properties of the Tax proteins. To systematically investigate PDZ-containing proteins roles in HTLV-1 biology, we initiated a global interactome network analysis of Tax and associated human PDZ-containing proteins. This was accomplished through the use of our framework of binary interactome mapping that includes stringent yeast two hybrid and pulldown screening, systematic retesting by protein complementation assay and evaluation of PDZ gene expression in T lymphocytes. [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailInhibition of Tax transformation activity using a small molecule targetting Tax/PDZ domain interactions.
Blibek, Karim ULg; Fujii, Naoki; Legros, Sebastien et al

Poster (2013, June 29)

Primate T-lymphotropic virus species comprise four members (HTLV-1 to -4) that have been discovered in human. Only the HTLV-1 infection leads to adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL). All the four viruses ... [more ▼]

Primate T-lymphotropic virus species comprise four members (HTLV-1 to -4) that have been discovered in human. Only the HTLV-1 infection leads to adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL). All the four viruses share a similar genomic organization and encode transforming Tax oncoproteins. In contrast to HTLV-2 and 4, HTLV-1 and 3 Tax proteins contain a PSD-95/Drosophila Discs Large/Zona Occludens-I (PDZ) binding motif at their C-terminal that has been shown to play crucial roles in the distinct transforming properties of the Tax proteins. Here, we used a collection of human full-length protein-coding open reading frames (ORFeome v3.1) to identify novel PDZ domain containing proteins that specifically interact with HTLV-1 Tax. Novel Tax interactors include syntenin-1 and -2, LNX2, DVL3, GIPC2, INTU, PDLIM4 and -7, RADIL and RGS3. These proteins are involved in diverse biological processes including cell division, cell fate determination and cell suvival. We further characterized interaction between Tax and syntenins and showed that, FJ9 a small molecule able to disrupt Tax/PDZ interactions, could antagonize Tax-transformation activity in rat-1 model. Our study identify novel PDZ-containg proteins interacting with HTLV-1 Tax and provides the first example where Tax protein-protein interactions whith PDZ-containing proteins and Tax-transformation capacity could be inhibited by a small molecule. [less ▲]

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Peer Reviewed
See detailDisruption of PDZ protein-protein interactions inhibits Tax transformation and HTLV-1 infection capacities.
Twizere, Jean-Claude ULg; DEWULF, Jean-François; Blibek, Karim ULg et al

Poster (2011, June 06)

Human T-cell leukemia virus type I (HTLV-1) encodes a Tax oncoprotein that is critical for both viral replication and cellular transformation. HTLV-1 Tax possesses a PDZ domain binding motif (PBM) at its ... [more ▼]

Human T-cell leukemia virus type I (HTLV-1) encodes a Tax oncoprotein that is critical for both viral replication and cellular transformation. HTLV-1 Tax possesses a PDZ domain binding motif (PBM) at its C-terminus that is essential for its transforming activity in a Rat-1 model and for IL-2. Tax has been shown to interact with several PDZ domain containing proteins including PSD-95, Beta1-syntrophin, the precursor of interleukin-16, the mammalian homolog of the Drosophila discs large tumor suppressor protein Dlg, PDLIM2, Lin7, hTid1, Tip1, hScrib and MAGI3. In the 15th International Conference on Human Retrovirology: HTLV and Related Retroviruses, we will present a specificity map for the Tax/PDZ domain interactions generated using the human ORFeome 5.1. and we will focus on some of the new Tax/PDZ interactions. [less ▲]

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See detailIdentification de nouvelles interactions entre les protéines à domaines PDZ et les protéines kinases.
Blibek, Karim ULg

Master's dissertation (2010)

RESUME Les protéines sont les moteurs fondamentaux de l’organisation cellulaire en assurant la régulation des aspects fonctionnels et structuraux des cellules. Pour établir et maintenir l’homéostasie ... [more ▼]

RESUME Les protéines sont les moteurs fondamentaux de l’organisation cellulaire en assurant la régulation des aspects fonctionnels et structuraux des cellules. Pour établir et maintenir l’homéostasie cellulaire, les protéines s’interrégulent entre elles en interagissent via des domaines d’interactions protéiques, jouant le rôle d’adaptateurs. Les domaines PDZ (PSD-95, DLG-1 et ZO1) sont des domaines d’interactions protéines-protéines impliqués dans la polarité, la signalisation et l’adressage. Ces domaines protéiques reconnaissent en général, un motif consensus en extrémité C terminale de la protéine cible (motif de type I, II et III). Les protéines à domaines PDZ ont un rôle reconnu dans le développement des cancers, en régulant de différentes manières, les fonctions de protéines oncogènes ou suppresseurs de tumeur (kinases, phosphatases,…). Les protéines kinases sont souvent codées par des oncogènes, qui constituent, une fois mutés, l’un des acteurs majeurs de la tumorigènese. Certaines kinases présentent un motif consensus C terminal potentiellement reconnu par les domaines PDZ. De ce fait, une meilleure compréhension des interactions PDZ-kinases permettra d’apporter des éclairages nouveaux sur leur implication dans le développement tumoral. Mon projet de master 2 s’est porté sur l’identification par double hybride en levure de nouvelles interactions entre les protéines à domaines PDZ et les protéines kinases, afin de construire une matrice d’interactions, qui va compléter les travaux déjà initiés au sein de notre équipe de recherche. Après avoir obtenu par amplification PCR, 29 séquences C terminales de kinases contenant un motif consensus de type I, j’ai cloné celles-ci dans des vecteurs adéquats qui sont transformés dans des levures Ah109. En accouplant ces dernières avec les levures partenaires Y187 prétransformés avec notre ressource de domaines PDZ, j’ai pu détecter les interactions par test phénotypiques impliquant la reconstitution du facteur de transcription Gal4. Parmi tous les tests réalisés, 350 se sont révélés positifs. L’analyse par une approche de bioinformatique, m’a permis de distinguer les nouvelles interactions non décrites dans la littérature, interactions auxquelles je pourrai m’intéresser plus particulièrement, en essayant de les valider biochimiquement et fonctionnellement. Ainsi, dans l’optique d’un projet de thèse, la matrice générée peut être exploitée de différentes manières, afin d’extraire les informations regroupées au sein de cette base de données. Toutefois, il est impératif de confirmer les interactions détectées en faisant appel à d’autres techniques, telles que le pull-down, le Biacore, la coIP…etc. En outre, La relevance physiologique de ces interactions peut être testé par invalidations de gènes (mutations, siRNA,…etc.). La détection de toutes ces interactions nous permettra de décrire de nouvelles implications des domaines PDZ dans les voies cellulaires kinases-dépendantes. Et dans l’idéal, projeter le design d’une molécule pouvant moduler une interaction in vivo pour aboutir à un effet anticancéreux. [less ▲]

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See detailEtude de la modulation de la NO synthase 2 par l'éxtrait de pépins de raisin, au cours de l'hydatidose humaine: Impact sur la production du monoxyde d'azote (NO)
Blibek, Karim ULg

Master of advanced studies dissertation (2009)

Résumé L’hydatidose est une zoonose cosmopolite qui sévit de façon endémique en Algérie. Cette parasitose est causée par la forme larvaire d’un cestode Echinococcus granulosus. Le diagnostic de ... [more ▼]

Résumé L’hydatidose est une zoonose cosmopolite qui sévit de façon endémique en Algérie. Cette parasitose est causée par la forme larvaire d’un cestode Echinococcus granulosus. Le diagnostic de l’hydatidose orienté par les arguments cliniques et radiologiques reste largement dominé par l’immunosérologie. L’établissement d’un diagnostic de certitude est délicat, notamment en raison de la vaste communauté antigénique que constitue l’hydatide. Dans la mesure où cette affection est souvent asymptomatique, le traitement reste essentiellement chirurgical avec risque de récidive. La survenue de complications au cours de l’évolution de cette macroparasitose et l’apparition d’échinococcose secondaire rendent l’acte chirurgical difficile. Dans l’optique de la recherche d’une thérapie anti-hydatique et sur la base de plusieurs travaux ayant déjà permis de mettre en évidence le rôle de certaines molécules dans la réponse immunitaire contre le parasite, nous nous sommes intéressé à l’étude de l’effet de l’extrait des pépins de raisin sur la culture des PBMC sensibilisées au liquide hydatique. Parmi les facteurs solubles impliqués dans les mécanismes anti parasitaires, on cite le monoxyde d’azote, qui est définit comme étant un biomédiateur synthétisé par les NO synthases (NOS). C’est un messager intracellulaire et un agent effecteur de nombreuses fonctions biologiques, il a été détecté au cours de microparasitoses telles que la leishmaniose. Ce radical hautement réactif intervenant dans l’inflammation serait impliqué dans les mécanismes de défense de l’hôte contre E.granulosus au cours de l’hydatidose. Le but de ce travail est d’apporter des arguments en faveur du rôle anti-inflammatoire de l’extrait des pépins de raisin sur la modulation de la sécrétion du NO au cours de l’hydatidose. Notre travail s’est essentiellement porté sur : Le dosage des protéines du liquide hydatique issu de patients porteurs de kystes hydatiques selon plusieurs localisations, le test de viabilité des protoscolex récupérés à partir du liquide hydatique, l’implication in vitro des PBMC dans la biosynthèse du NO, stimulés par le liquide hydatique et l’étude in vitro de l’effet anti inflammatoire de l’extrait des pépins de raisin, dans la variation des taux de production du NO à partir des PBMC stimulés au liquide hydatique. Les tests in vitro ont montré que l’extrait des pépins de raisin aurait un effet modulateur négatif sur la production du NO. Une corrélation positive a été rapportée entre l’expression de la NOS II et le taux de NO produit. Cette expression serait négativement corrélée par l’effet inhibiteur de l’extrait des pépins de raisin à une dose inférieur à 20 µg/ml. Cette molécule anti-inflammatoire pourrait avoir un effet souhaitable lors d’une bithérapie anti-hydatique, dans le sens où elle modulerait la sécrétion du NO et éviterait ainsi son effet cytotoxique. [less ▲]

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