Origin and evolution of SR proteins in Eukaryotes

Poster (2009, February 05)

Patrocles: a database of polymorphic miRNA-mediated gene regulation

Conference (2008, March 03)

Lack of resolution in the animal phylogeny: Closely spaced cladogeneses or undetected systematic errors?

in Molecular Biology and Evolution (2007), 24(1), 6-9

A recent phylogenomic study reported that the animal phylogeny was unresolved despite the use of 50 genes. This lack of resolution was interpreted as "a positive signature of closely spaced cladogenetic ... [more ▼]

A recent phylogenomic study reported that the animal phylogeny was unresolved despite the use of 50 genes. This lack of resolution was interpreted as "a positive signature of closely spaced cladogenetic events." Here, we propose that this lack of resolution is rather due to the mutual cancellation of the phylogenetic signal (historical) and the nonphylogenetic signal (due to systematic errors) that results from inadequate taxon sampling and/or model of sequence evolution. Starting with a data set of comparable size, we use 3 different strategies to reduce the nonphylogenetic signal: 1) increasing the number of species; 2) replacing a fast-evolving species by a slowly evolving one; and 3) using a better model of sequence evolution. In all cases, the phylogenetic resolution is markedly improved, in agreement with our hypothesis that the originally reported lack of resolution was artifactual. [less ▲]

Phylogénomique des lignées photosynthétiques

Scientific conference (2006, December 22)

The animal phylogeny and the fundamental importance of taxon sampling

Scientific conference (2006, February 20)

Assessing the effects of compositional heterogeneity on phylogenomic analyses

Conference (2005, November 04)

Le darwinisme peut-il tout expliquer ?

Conference given outside the academic context (2005)

Vus d'Europe, les procès opposant les farouches défenseurs du darwinisme à leurs pugnaces détracteurs ont de quoi faire sourire. Certes, il n'y a pas qu'aux Etats-Unis que l'on puisse encore trouver des ... [more ▼]

Vus d'Europe, les procès opposant les farouches défenseurs du darwinisme à leurs pugnaces détracteurs ont de quoi faire sourire. Certes, il n'y a pas qu'aux Etats-Unis que l'on puisse encore trouver des Chrétiens fondamentalistes persuadés que Dieu a créé la Terre en six jours. En revanche, aucun gouvernement de nos contrées n'aurait l'idée saugrenue de faire interdire l'enseignement de la théorie de l'évolution dans nos écoles, ni même de l'autoriser à la condition expresse de la traiter sur le même pied que le créationnisme inspiré d'une lecture littérale de la Genèse. Cela dit, croire que le refus de l'évolution par "sélection naturelle des mutations favorables" se limite aux couches populaires de l'Amérique conservatrice serait inexact. En réalité, les plus acharnés des tenants du créationnisme pur et dur -- ou de son avatar à peine plus subtil, l'Intelligent Design -- sont généralement des intellectuels, voire dans certains cas des biologistes qui ont renoncé à toute carrière dans l'orthodoxie académique. Faut-il n'y voir qu'aveuglement religieux ? Sans doute, mais pas seulement... Originellement proposée en 1859, la théorie de l'évolution de Charles Darwin a profondément bouleversé la science et la société toute entière. Débarrassé de ses relents lamarckiens par August Weismann entre 1883 et 1888, le darwinisme, désormais qualifié de "néo-", s'est enrichi de la génétique de Gregor Mendel pour donner naissance en 1937, sous l'impulsion de Theodosius Dobzhansky, à la théorie synthétique de l'évolution. C'est dans cette incarnation "moderne" qu'il est devenu l'unique paradigme de la biologie contemporaine. Pourtant, loin des feux de la rampe, le couple infernal mutation/sélection ne satisfait pas tous les spécialistes. A quel point sa toute puissance peut-elle être mise en doute ? Dispose-t-on réellement de preuves de son efficacité, ou même tout simplement de son existence ? La diversité de la Vie sur Terre peut-elle s'expliquer par un principe aussi naïvement libéral ? C'est à ces questions et à quelques autres que nous tenterons de répondre au cours de cette conférence-débat, tout en tâchant de rester prudemment en dehors de toute considération métaphysique. Docteur en Sciences (Génétique Moléculaire Végétale), Denis BAURAIN est bioinformaticien à l'Université de Liège. Financées par le FNRS, ses recherches portent essentiellement sur l'histoire évolutive des premières cellules à noyau telle qu'on peut l'inférer à partir des séquences de gènes. [less ▲]

Why does the red algal plastid lineage lack plastocyanin?

Conference (2005, February 03)

A comparative inventory of metal transporters in the green alga Chlamydomonas reinhardtii and the red alga Cyanidioschizon merolae

in Plant Physiology (2005), 137(2), 428-446

Condensé de biologie moléculaire à l'usage des biomathématiques et de la bioinformatique

Scientific conference (2004, October 26)